Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOJQ9H4E5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms