Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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