Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms