Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF6Q9BYE7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms