Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms