Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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