Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms