Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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SEC22CQ9BRL7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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SEC22CQ9BRL7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SEC22CQ9BRL7 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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SEC22CQ9BRL7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SEC22CQ9BRL7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEC22CQ9BRL7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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