Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.2 ms