Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VGLL1Q99990 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms