Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD1Q99460 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms