Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms