Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms