Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms