Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms