Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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