Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms