Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF128Q8TEB7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms