Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms