Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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