Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms