Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms