Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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