Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms