Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VWA5B2Q8N398 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms