Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms