Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.7 ms