Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms