Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms