Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms