Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms