Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms