Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms