Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms