Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms