Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDRF1Q3B7T1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms