Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P3H1Q32P28 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms