Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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