Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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