Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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DDB1Q16531 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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DDB1Q16531 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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DDB1Q16531 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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DDB1Q16531 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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DDB1Q16531 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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