Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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