Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms