Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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