Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CDSNQ15517 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CDSNQ15517 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CDSNQ15517 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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