Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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