Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms