Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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