Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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