Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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