Protein–RNA interactions for Protein: Q13066

GAGE2B, G antigen 2B/2C, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE2BQ13066 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GAGE2BQ13066 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms